Numizmatikos rinkinyje šiuo metu yra 3653 eksponatai. Jį sudaro monetos (proginės, apyvartinės), medaliai (proginiai, apdovanojimo), ženkleliai (suvenyriniai, proginiai), bonistika. Didžioji jų dalis temiškai atspindi pasaulinės jūreivystės istoriją: geografinių atradimų keliones, žymius jūrininkus, jūrų mūšius, žvejybą ir jūrų prekybą, jūrinių valstybių ir uostamiesčių raidą bei istorinius įvykius. Rinkinys pildomas, įsigyjant eksponatus iš privačių kolekcijų, Lietuvos banko.
Unikali rinkinio dalis – 1918–1923 m. infliacininių markių banknotai, kuriame daugiau nei 300 įvairių Vokietijos ir Austrijos–Vengrijos miestų it vietovių laikinų pinigų.
Numizmatikos rinkinys skaitmeninamas. Šiuo metu LIMIS viešojoje prieigoje yra pateikta daugiau nei 600 eksponatų.
